Nat Biotechnol:研究不能重复?可能是HeLa细胞系“不定”了

2022-01-24 04:05:55 来源:
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HeLa巨噬细胞之前在亚洲地区的许多物理室培养单单来了有约70年,并且长期以来被视为是无限供应的不逆的相同巨噬细胞。然而,2月末18日刊载在《Nature Biotechnology》杂志上的一项新深入研究表明,巨噬细胞在相同物理室相互间长期存在相当大相异,这引发了对巨噬细胞另有深入研究重复开放性的批评。“我很高兴看到这项深入研究,但在某种普遍性上我并不一定无法忍受不快,”斯隆迪恩恩癌症中都心的分子生物科学家Prasad Jallepalli时说,他没有参与这项深入研究。这并不一定是HeLa巨噬细胞另有自诞生以来第一次单单现多样化的报道:长期以来,其他深入研究小组也证明了HeLa巨噬细胞突专有名词相互间在DNA序列和RNA强调的显着相异。这项最新深入研究首次全面分析了各种HeLa突专有名词的表现型突逆(相同批次的HeLa巨噬细胞另有生活在亚洲地区的各个物理室),并且首次证明表现型异质开放性导致了细胞内强调和表观的波动。HeLa巨噬细胞“逆了”?在这项深入研究中都,深入研究职员从6个国家的13个物理室收集了14份HeLa样本,并在相同的物理室状况下进行培养单单来。他们首先取样了DNA拷贝数突逆,揭示了它们DNA组相互间的显着相异。结果挖掘单单,HeLa突专有名词相互间,特别是CCL2和Kyoto突专有名词相互间长期存在着巨大的异质开放性。进一步的已经有,许多这些表现型相异转化成为mRNA产生的波动,并且在较小程度上转化成为细胞内丰度的波动。深入研究职员统计数据时说,HeLa CCL2和Kyoto巨噬细胞另有的转录组和细胞内组谱彼此相互间的相异,就像来自两种相同类型组织的癌巨噬细胞另有相互间的相异一样。HeLa突专有名词在培养单单来步骤中都潮湿速度也相同,一些巨噬细胞群需17.5星期才能加倍,而另一些巨噬细胞在相同的培养单单来状况下需话费超过32星期。它们对芽孢感染者的反应也有所相同:与其他两种专有名词相比,一种专有名词对感染者的敏感开放性较低,深入研究职员将其归咎于低水平的细胞内复合物,这种细胞内复合物在细菌转到宿主巨噬细胞中都起抑制作用。在一项分开的物理中都,深入研究小组通过培养单单来巨噬细胞另有三个月末,来观察HeLa突专有名词的DNA强调究竟会随着时间发生波动。深入研究职员记录了更早巨噬细胞和晚期巨噬细胞相互间DNA强调相异差不多6%。苏黎世联邦理工学院分子另有统生物科学深入研究所的Ruedi Aebersell副教授是该深入研究的合着者,他时说,“即使在同一个物理室里,这些巨噬细胞的相异和波动速度也是更为惊人的。”他估计,如果一个深入研究生在计划开始时用HeLa巨噬细胞另有想到了一个物理,并在六个月末后被要求重复这个物理,他们可能会给与相同的结果。关于深入研究中都的“可遗传物质开放性巨逆”的辩论大多数集中都在物理设计、数据分析方面的缺陷,以及作为主要驱动因素的受空气污染或附上错标签的巨噬细胞另有。但是Aebersell视为,HeLa巨噬细胞另有和癌巨噬细胞另有的生物科学相异可能是更为重要。为什么会“逆”?哥伦比亚大学的巨噬细胞生物科学家Tim Stearns视为有几个可能的原因可以表述为什么巨噬细胞另有在但会培养单单来下都发生波动。首先,HeLa巨噬细胞是已知DNA组不稳定的癌巨噬细胞,因此很可能随时间随机突逆。此外,它们还会在物理室中都受到各种潮湿状况的影响,这可能会促使巨噬细胞进化单单奇特的不同之处。例如,他时说,哺乳动物巨噬细胞的培养单单来包括将其培养单单来到带给一个培养单单来皿为止,从培养单单来皿中都抽取一部分巨噬细胞,然后将它们放在另一个培养单单来皿中都潮湿,这一步骤叫做分裂。“每个人想到这件事的模式都有点相同,”他时说道。最新这些挖掘单单,对于人类培养单单来巨噬细胞的深入研究结果的表述和重现开放性有一定的普遍性。Aebersell和他的同事在专著中都提单单了几个具本体的提高效率。首先,深入研究职员某种程度常用癌巨噬细胞另有的更早传代,并确保安全在同一巨噬细胞另有的相同样本中都重复同一巨噬细胞另有的物理。更重要的是,生物科学家某种程度清楚地统计数据他们在给定的深入研究中都常用的巨噬细胞另有突专有名词。
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